Высшая школа прикладной физики и космических технологий была создана в июне 2016 года в рамках реализации проекта повышения конкурентоспособности российских вузов «5-100-2020».
В 2016 году Министерство образования и науки РФ в рамках Программы «5-100» рекомендовало вузам определить в структуре университетов стратегические академические единицы - САЕ (структурные подразделения), которые имеют достаточный потенциал для трансформации университета и вывода его на безусловные лидерские позиции на национальном и международном уровне.
В СПбПУ было создано две САЕ:
- Институт перспективных производственных технологий
- Высшая школа прикладной физики и космических технологий (на базе ИФНиТ).
В 2016 году в состав Высшей школы вошли научные лаборатории и группы ИФНиТ, получившие финансовую поддержку в рамках программы.
В 2017 году в ходе реструктуризации ИФНиТ в ВШ перешли сотрудники трех кафедр института: Радиофизика, Интегральная электроника, Радиотехнические и телекоммуникационные системы:
Структура Высшей Школы:
План развития на 2017–2020: